在脈沖除塵器的日常運行中，由于運行條件會發生某些改變，或某些故障，都將影響設備的正常運轉狀況和工作性能，要定期地進行檢查和適當的調節，目的就是延長除塵布袋的使用壽命，降低動力消耗及回收有用的物料。應當注意的事項有：
1、運行記錄
每個通風除塵系統都要安裝和備有必要的測試儀表，在日常運行中定期進行測定，并準確地記錄下來，這就可以根據系統的壓差，進、出口氣體溫度，主電機的電壓、電流等的數值及變化來進行判斷，并及時地排出故障，確保其正常運行。
通過記錄發現的問題有：清灰機構的工作情況，除塵布袋的工況（破損、糊袋、堵塞等問題），以及系統風量的變化等。
2、流體阻力
壓差可用來判斷運行情況，如壓差增高，就意味著除塵布袋出現堵塞、濾袋上有水汽冷凝、清灰機構失效、灰斗積灰過多以致堵塞濾袋、氣體流量增多等情況。而壓差降低則意味著出現了濾袋破損或松脫、進風側管道堵塞或閥門關閉。箱體或各分室之間有泄漏現象、風機轉速減慢等情況。
3、安全
脈沖除塵器要特別注意采取防止燃燒、爆炸和火災事故的措施。在處理燃燒體或高溫氣體時，常常有未完全燃燒的粉塵、火星、有燃燒和爆炸性氣體等進入系統之中，有些粉塵具有自燃著火的性質或帶電性，同時，大多數濾料的材質又都是易燃燒、磨擦易產生積聚靜電的，在這樣的運轉條件下，存在著發生燃燒、爆炸事故的危害，這類事故的后果往往是很嚴重的。應很好地考慮采取防火、防爆措施，如：
⑴ 在除塵器的前面設燃燒室或火星捕集器，以便使未完全燃燒的粉塵與氣體完全燃燒或把火星捕集下來。
⑵ 采取防止靜電積聚的措施，各部分用導電材料接地，或在濾料制造時加入導電纖維。
⑶ 防止粉塵的堆積或積聚，以免粉塵的自燃和爆炸。
⑷ 人進入袋室或管道檢查或檢修前，務必通風換氣，嚴防CO中毒
4、停止作業注意事項
當脈沖除塵器停止運行前除清灰外，還應注意下列問題：
⑴ 袋室內往往發生濕氣凝結現象，這是含濕氣體，特別是燃燒產生的氣體冷卻后引起，因此，要在系統冷卻之前，把含濕氣體排出去，完全換上干燥的空氣，也就是在工藝設備停止運轉后，脈沖除塵器的排風機應運行一段時間后，才停止運行。
⑵ 在長期停止運轉期間，要充分注意風機的清掃、防銹等工作，防止灰塵和雨水進入軸承(注意電動機的防潮)。在停止運轉前，應把灰斗內的積灰排除干凈。清灰機構與驅動部分要充分
⑶ 在脈沖除塵器停止運轉期間，定期的進行短時間的運行（空運轉）是確保除塵系統正常運轉好的維護方法。